MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p3ABSDF

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010398	T	7	7	60	66	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010398	TTAT	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010398	AAT	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010398	ATA	2	6	147	152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010398	CGAG	2	8	158	165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010398	CAT	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010398	GCTTTT	2	12	283	294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010398	AGCGA	2	10	306	315	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010398	TGCTTT	2	12	328	339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010398	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010398	TA	3	6	475	480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010398	AAT	3	9	539	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010398	ACTA	2	8	1494	1501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010398	CTTTG	2	10	2082	2091	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010398	AAAT	2	8	2107	2114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010398	ACA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010398	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010398	A	6	6	2143	2148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010398	TATT	2	8	2179	2186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010398	T	6	6	2198	2203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010398	AGCT	2	8	2223	2230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010398	CT	3	6	2998	3003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010398	CACG	2	8	3022	3029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010398	TAAA	2	8	3041	3048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010398	CAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010398	TAT	2	6	5535	5540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010398	CGAG	2	8	6346	6353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010398	AGCGA	2	10	6444	6453	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010398	AGCGA	2	10	6505	6514	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010398	CTTTTG	2	12	6526	6537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010398	AATA	2	8	6552	6559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010398	A	6	6	6559	6564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010398	T	7	7	6644	6650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010398	AAT	2	6	6651	6656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010398	GTT	2	6	6678	6683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010398	T	7	7	6682	6688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010398	AT	3	6	6702	6707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010398	TAAT	2	8	6815	6822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010398	ATGT	2	8	6851	6858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010398	TGAT	2	8	9928	9935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010398	ATT	2	6	9937	9942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010398	TGA	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010398	TCC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010398	T	7	7	9997	10003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010398	ATA	2	6	13795	13800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010398	T	7	7	13885	13891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010398	A	6	6	14018	14023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010398	TC	3	6	14030	14035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010398	CAA	2	6	15633	15638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010398	TC	3	6	16604	16609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010398	TAGT	2	8	16611	16618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010398	AGT	2	6	16638	16643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010398	TAGT	2	8	16654	16661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010398	TAGT	2	8	16675	16682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010398	CCTA	2	8	16735	16742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010398	AAT	2	6	16763	16768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010398	TTCGC	2	10	16801	16810	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010398	T	7	7	16819	16825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010398	TGAT	2	8	16895	16902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010398	T	7	7	16980	16986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010398	T	6	6	17030	17035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010398	A	7	7	17124	17130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010398	CTT	2	6	17204	17209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010398	CAG	2	6	17238	17243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010398	TTTC	2	8	17287	17294	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010398	A	8	8	17304	17311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010398	ACG	2	6	17345	17350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010398	ATA	2	6	18181	18186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010398	TAA	2	6	18187	18192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010398	TAAT	2	8	18208	18215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010398	A	6	6	18224	18229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010398	A	6	6	18264	18269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010398	ATT	2	6	18274	18279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010398	TAACT	2	10	18299	18308	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010398	A	7	7	18311	18317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010398	T	6	6	18372	18377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010398	TAT	2	6	18398	18403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010398	TTA	2	6	18412	18417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010398	A	6	6	18437	18442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010398	TTA	2	6	18443	18448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010398	TAG	2	6	18454	18459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010398	AT	3	6	18461	18466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010398	TAA	3	9	18685	18693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010398	TAA	2	6	18698	18703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010398	T	7	7	18721	18727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010398	A	6	6	18753	18758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010398	A	6	6	18764	18769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010398	T	6	6	19016	19021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010398	AAT	2	6	19029	19034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010398	T	7	7	19057	19063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010398	AT	4	8	19070	19077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010398	AC	3	6	19158	19163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010398	TTG	2	6	19183	19188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010398	ATTT	2	8	19272	19279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010398	CGTG	2	8	19292	19299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010398	AATGC	2	10	19357	19366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010398	GAT	2	6	19392	19397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010398	T	6	6	19408	19413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010398	ACCT	2	8	19422	19429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010398	ATTC	2	8	19452	19459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010398	CT	3	6	19460	19465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010398	TTC	2	6	19502	19507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010398	TCAC	2	8	19649	19656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010398	TTGT	2	8	19658	19665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010398	CGA	2	6	19733	19738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010398	CGA	2	6	19803	19808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010398	GTC	2	6	19866	19871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010398	AAAG	2	8	19954	19961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010398	ACA	2	6	19986	19991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010398	CTT	2	6	20154	20159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010398	GAA	2	6	20180	20185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010398	CAA	2	6	20207	20212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010398	ATT	2	6	20289	20294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010398	T	8	8	20338	20345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010398	A	6	6	20347	20352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010398	GAT	2	6	20382	20387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010398	TGA	2	6	20399	20404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010398	TTTA	2	8	20431	20438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010398	T	6	6	20443	20448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010398	AGGGT	2	10	20480	20489	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010398	ACT	2	6	20535	20540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010398	GTT	2	6	20551	20556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010398	ACC	2	6	20564	20569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010398	T	6	6	20604	20609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010398	A	6	6	20614	20619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010398	ATTC	2	8	20661	20668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010398	T	6	6	20673	20678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010398	A	6	6	20702	20707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010398	GAT	2	6	20724	20729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010398	T	7	7	20793	20799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010398	T	6	6	20851	20856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010398	TTGATT	2	12	20873	20884	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010398	ATT	2	6	20988	20993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010398	TAAA	2	8	21035	21042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010398	ATA	2	6	21111	21116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010398	TAAAA	2	10	21118	21127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010398	TTAT	2	8	23273	23280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010398	TAT	2	6	23317	23322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010398	TGA	2	6	23325	23330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010398	T	8	8	23350	23357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010398	T	8	8	23367	23374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010398	T	6	6	23386	23391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010398	ATCG	2	8	23424	23431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010398	GAA	2	6	23453	23458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010398	AT	3	6	23477	23482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010398	GTGA	2	8	23490	23497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010398	ACT	2	6	23526	23531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010398	TTG	2	6	23543	23548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010398	TAA	2	6	23708	23713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010398	AAT	2	6	23752	23757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010398	T	6	6	23768	23773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010398	AAT	2	6	23876	23881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010398	GAC	2	6	23911	23916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010398	A	9	9	24119	24127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010398	T	6	6	24148	24153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010398	AT	3	6	24858	24863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010398	ATA	2	6	24892	24897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.